高中二年級(jí)學(xué)生真夏大地在暑假開(kāi)始前的晚上，在電視上目睹了種子島上空突如其來(lái)的不可思議的圓形虹光。曾經(jīng)見(jiàn)過(guò)這種虹光的大地內(nèi)心洶涌澎湃，決定一個(gè)人向著種子島進(jìn)發(fā)。“父親因事故而死亡的謎題”、“幼年時(shí)遇到過(guò)的不可思議的少女的記憶”等復(fù)雜思緒從胸口涌出。到達(dá)種子島的大地因某設(shè)施的報(bào)警聲而與“EarthEngine”相遇。“你就是隊(duì)長(zhǎng)嗎…”伴隨著詢(xún)問(wèn)聲，大地看到的是從天王星襲來(lái)的謎之完全機(jī)械生命體“KILL-T-GANG”，少年的冒險(xiǎn)也在這絢爛星空中拉開(kāi)帷幕。
真夏在未經(jīng)通報(bào)的情況下駕駛機(jī)器人“地球號(hào)”出動(dòng)，基地眾人驚訝中迎擊“KILL-T-GANG"來(lái)襲，但是由于沒(méi)有經(jīng)過(guò)任何訓(xùn)練，遭受到了機(jī)械生命體的重創(chuàng)，這時(shí)博士緊急調(diào)用一神秘黑客侵入導(dǎo)航系統(tǒng)，間接控制住機(jī)體，輔助迎擊。在黑客神秘聲音的配合下，真夏大地終于擊退來(lái)犯的機(jī)械生命體，并回到基地。在基地中，真夏以外的遇到了幼時(shí)遇到的神秘少年（嵐徹平）與被他喚醒的神秘少女（夢(mèng)塔花），只是二人的處境似乎并不太妙，而且真夏也將面臨同樣的處境。在方舟派針對(duì)迎擊派的陰謀中，真夏將如何面對(duì)呢？
神秘黑客登場(chǎng)，居然是基地司令5年未見(jiàn)的女兒——夜祭明，并且似乎暴露了一段司令的糟糕私生活？自由了的徹平和花與夜祭明真夏一起住進(jìn)了司令家中。幾天后新的敵人來(lái)犯，方舟派的salty?dog為了陷害真夏而向真夏透露來(lái)犯者是他的殺父仇人。本應(yīng)被禁止出擊的真夏在方舟派的慫恿下出擊，然后還未維修的破敗機(jī)體幾乎導(dǎo)致全敗的局面，就在真夏危機(jī)的時(shí)刻，徹平和花聯(lián)手出動(dòng)了，他們的真實(shí)身份到底是什么呢？