宮中一片混亂，王重病，御醫女領頭懷疑是瘟疫，此時作為御醫女的洪多仁(宋智孝)提出王是食物中毒，正在最好御醫給王針灸時，王世子(任瑟雍)到了阻止御醫針灸，理由是御醫手在抖，然后王世子要求崔元(李東旭)來治療。
但是幾個御醫反對，崔元平日不務正業，而且醫術不好，但是王世子和御醫女領頭堅持崔元為王針灸。派多仁去找崔元。但崔元堅持不為王施針，最后還是由王世子的醫官閔主簿為王施針。
崔元的女兒崔瑯身患怪病，為了治療小瑯的病，崔元利用在宮中當值的空擋前往禁書庫偷取醫術不料被世子的護衛發現追趕，在躲避追捕時遇上了正在為小官婢治療的多仁，崔元提醒多仁要將患病的小官婢送出宮但多仁也以崔元偷書為要挾，兩人不歡而散。
小瑯為崔元送來衣物在進宮時被多仁解圍，但意外的發現了世子殿外正準備引爆的炸藥，多仁在帶小瑯見崔元時炸藥爆炸，在殿內的世子與崔元和在殿外的多仁與小瑯，四人同時陷入了一個巨大的陰謀中。
由于素正波的所行，東宮殿發生了火災，進入殿內的遠把李浩救了出來。李浩決定對這件事既往不咎，去找遠對他說自己會幫他治療他女兒的病，請求他守護在自己的身邊。最終遠還是拒絕了李浩的請求。
為了把《金怪婦用方》還回去，再次進入了金書庫的遠，為了幫助正在被宮中士兵追趕的醫女達仁一起被關在了金書庫里面，只有兩個人。第二天，閔道聲被發現死在了金書庫，遠被嫁禍了殺人的罪名。
遠被誣陷為殺死閔道聲的殺人犯，被義禁府道使李政環追捕，他的一家變得支離破碎。再加上患有肺結核的女兒朗的狀態也變得很嚴重。
另一邊，多仁知道了崔遠就是她懇切地尋找著的救命恩人。并且知道了因為自己在金書庫掉落的玉佩，崔遠才被誣陷為殺人犯，為了證明他的清白，跑去了義禁府。
崔元被誣陷殺害和自己有著總角之交的閔道生，恐被處刑的崔元找到李峼跪求與他“請救我一命，殿下!我不能就這么死了，不能丟下小瑯一個人。全都聽殿下您的吩咐。”