小曹操欲乘船而逃，卻被齊雁南追上。他被齊雁南用槍指著，知道自己已是窮途末路，但他也否認自己是教授，并告訴齊雁南，焦鋒不是他殺的，黑三也是教授的人，他特意讓黑三把齊雁南引到自己這邊，為的是想借刀殺人。小曹操趁齊雁南不備時，在船底摸出一把手槍，齊雁南眼明手快，決定先下手為強，對著他開了槍。小莉等人此時還在較遠處，不知道具體情況，只看見是齊隊對著小曹操開的槍。人之將死，其言也善，在齊雁南的追問下，小曹操臨時前告訴他一條重要的線索，就是要找到教授，要先找到柯世蘭。
馬局看見戴局把指揮工作做得十分好，對于下屬也非常照顧，身上有著一腔刑警的熱血，于是想提拔他為負責刑偵的第一副局長。正當戴局猶豫著要不要接受時，突然傳來了黑三死亡的消息。
如今黑三終究不治身亡，檢察官認為只憑齊雁南的一家之言，不足以讓人信服。
戴局從行動組的施然口中得知，黑三被送往醫院時念念有詞著五十萬，他覺得事有蹊蹺，心里似乎計劃著什么。他讓施然在齊雁南住院期間，好好“照顧”他。施然十分尊敬齊隊，當知道自己被命令監視齊隊時，有點不情愿，但軍令如山，只好照辦。
齊雁南也把小莉幾個親信找來，把當天小曹操告訴他的復述一遍，隨后讓他們以柯世蘭這個人作為線索，暗中展開查探。
修車行里，一位伙計正對著一位在車子底下修修整整的男人報告最近發生的事情。這位老板聽見小曹操命喪齊雁南之手，感到十分有趣，知道他把小曹操當成教授了。事情似乎都按著他的預期發展，這讓他風騷至極，隨后更是以呼風喚雨之勢，等著看齊雁南的好戲。
戴局前來探訪齊雁南，師徒倆多日未見，一見即十分投機，湊巧的是，戴局的妻子關霞也在這個醫院里。齊雁南在戴局離開病房后，便擅自出院，帶著施然出去走走。走著走著，便來到焦鋒犧牲的地方。他對著空氣，說了很多最近發生的事，還有對焦鋒的懷念。
小莉查探到關于柯世蘭的一些情況，于是借探病為由，在病房向齊雁南匯報。柯世蘭是個十分有錢的車迷，而且底子十分干凈，什么違法犯罪記錄都沒有。有趣的是，小莉查到他在多年前曾經做過蘇錦榮的司機。齊雁南一聽這名字，便覺得事情并不簡單。當年，老局長曾經帶隊查過蘇錦榮，但沒過多久，老局長便離任了，新上任的馬局也不知道跟姓蘇的有何關系，但肯定的是，這個蘇錦榮勢力頗大。他們還發現，柯世蘭曾經有過官司，他自己是原告，告的是一個報紙的主編，最后柯世蘭贏了這場官司。齊雁南認為，像柯世蘭這種人，卻跟一位記者較真，一定是被人抓住了把柄，他讓小莉試著從這位被告人入手，應該有意想不到的收獲。
齊雁南想從施然口中套點料子，但施然收到命令，不能透露太多，然而施然一向尊敬齊隊，多次欲言又止，齊雁南也不好為難他，只好配合著，好好當個病人。
林冰在警局繼續問話，涉及這次行動的戴局、小莉等人，都很配合地把所見所聞如實相告。而帶走黑三的施然和齊雁南現在則在醫院，暫時無法進行問話。當林冰提及當時黑三身上的槍傷時，林冰不斷提出一些毫無證據的假設，甚至在還推理出黑三是被齊隊開槍打死的。戴局等人被激怒了，在會議桌上有點失態。
小莉回去告訴隊友們，齊雁南讓他們秘密調查柯世蘭，并從當年被柯世蘭告上法庭的記者古力身上入手。大伙兒知道現在齊隊被無辜冤枉，但自己也沒有理據去推翻檢察院的推測，因此盡早找出真相，是對齊隊的最大支持。
事后，馬局把戴局單獨留下談話，言語間似有責備他控制不住自己情緒，以及不顧全大局之意。馬局知道戴局和齊隊關系匪淺，因此也能理解戴局的行為，但齊雁南現在涉嫌違法，為了秉公辦事，他提出以休養為由，把齊雁南停職。
小莉按照吩咐進行查探，隨后把查到的結果告訴齊雁南。當年被柯世蘭告上法庭的記者古力，揭發了一批批號有問題的營養液，這批營養液是柯世蘭推出的，可能因此得罪了他。
緝毒一隊徹夜幫齊雁南查案，戴局到了第二天早上來查看情況，發現他們整夜未宿，于是懷疑齊雁南秘密給他們安排了任務。
齊雁南去看望關霞，把自己被監視的事情告訴她。關霞熟知齊雁南的為人，對于他被查一事感到很意外，于是問及原因，但齊雁南自己都不知道因何事捅了婁子。齊雁南想出去調查，于是他拜托關霞幫個忙，假裝兩人找個有樹遮擋的地方聊天，以障眼的手法避開施然的視線，然后離開醫院。施然比較單純，就這么中計了。戴局讓施然回去接受檢察院的調查，順便問他齊雁南的情況，施然報告一切安好。施然回去時，另一位同事小李前來接班時，這時施然才發現把人給跟丟了。施然無奈，回去被戴局訓了一頓。
齊雁南去到報社，找到一位古力的舊下屬肖紅。肖紅告訴齊雁南，當年古力跟她一起調查柯世蘭，并掌握一些對柯世蘭不利的證據，但到了開庭時，原本給古力作證的人，都不約而同矢口否認給過古力作證。古力敗訴后，因不想牽連肖紅和其他人，于是獨自查找證據，消失了一段時間后，主編便宣布古力因官司敗訴而精神崩潰，甚至還被撤銷了記者資格，最后所有資料都被充公處理，由此可見，柯世蘭真的可以一手遮天。
施然被林冰他們問了一些情況，并提及黑三在神智不清時，嘴里嘟囔著一些話，里面有“五十萬”的字眼，這數目跟焦鋒和齊雁南涉嫌受賄的數目一樣，隨即引起了林冰的重視。施然在被問話之前，戴局讓他該怎么說就怎么說，但事后，施然莫名其妙被戴局訓了一頓，覺得十分冤屈。戴局擔心，檢察院的人聽施然這么一說，齊隊受賄的嫌疑就變大了。
小莉他們把查到的資料拿出來進行分析，齊雁南拿起一張照片，推斷柯世蘭應該就是教授沒錯。兩年前，他們曾經在南鑼鼓巷時的一次行動中收到教授會在那里出現，而一張照片就是兩年前柯世蘭在南鑼鼓巷被拍到的。種種跡象，說明柯世蘭就是教授。
馬局通知齊雁南他要停職的事，齊雁南雖然心有不甘，但也只能服從命令。齊雁南把他查到關于柯世蘭的信息，還有推斷他就是教授的想法告訴馬局，馬局知道后，也表示自己聽說過柯世蘭這個人，這人勢力頗大，因此叮囑齊雁南萬事小心，并讓他有機會跟戴局說一下情況。
齊雁南被停職后閑來無事，便去看望開茶館的媽媽。齊母見到兒子十分歡喜，并一臉壞笑地招呼他，原來齊母給他安排了一場相親。說時遲那時快，齊母的朋友王叔叔也把他的外甥女帶了過來，這位要和齊雁南相親的女子竟然就是林冰。齊雁南第一次見林冰，并不知道她跟自己有什么淵源，閑談之下，才發現在檢察院反貪局工作的林冰，原來就是查自己的人。林冰之前三番四次都見不到齊雁南，如今雖然以這種形式見的面，但也不失為一個問話的好機會。既然大家都互相知道對方的身份，擇日不如撞日，不如就此向齊雁南提問。
林冰向齊雁南提了很多假設性的問題都讓齊雁南十分反感，尤其是林冰提及焦鋒也有受賄的可能時，齊雁南顯得有點激動。他警告林冰，焦鋒是他的好兄弟，林冰不能因為自己妄作推斷就冤枉好人。隨后齊雁南給了林冰一個下馬威，他說林冰的所有推論都只是一個可能性，沒有實質證據，于是說她業務能力有待提升。林冰感到被看輕了，有點不愉快，但想想齊雁南也沒說錯，很多推論都是自己想出來的，于是覺得有點生氣，飯也沒吃便甩袖離去。
槍支武器的檢查報告出來了，三把槍和刀子上都有齊雁南的指紋，林冰就此讓警方給個說法。戴局則說，雖然有齊的指紋，但當時他在空手搏斗，當然不會放棄任何一個奪取武器的機會。與其瞎猜，不如找當事人來問話，齊雁南被召回警局，接受檢察院的問話。
齊雁南把事情的經過陳述一遍，并把自己是怎么收到黑三的線報，以及跟黑三接頭的過程都告訴林冰。齊雁南此時告訴林冰，他之前都是信任黑三的，直到他聽見小曹操臨死前說的話，才開始懷疑黑三，但如今兩人都死了，到底孰是孰非則無從印證。齊雁南在被問話時，當著大伙的面指責檢察院老是進行不實的猜測，他勸林冰他們不要局限于某一個毫無根據的可能性上，要從思維的框架中跳出來，多方面入手找出真相。
齊雁南正在被林冰問話時，小莉等人則按他的吩咐，先從古力入手進行調查。他們查到，古力目前正在青松精神病院。