持刀的是黑室成員砍手，他是李克江的好兄弟，他知道自己的大哥是為了雅德利才受了重傷，前來報復雅德利。砍手用開水燙雅德利，并威脅雅德利要忍氣吞聲。?回到黑室的秦敖以為可以繼續自己和扈渝雯的感情，卻不知道扈渝雯在兩年的潛伏生涯中已經真正愛上了陸涯，面對扈渝雯的冷淡，秦敖感到疑惑和尷尬。?雅德利無法忍受在黑室的遭遇，他離開黑室逃往重慶市區。焦急的眾人分頭尋找，扈渝雯和砍手找到了雅德利，卻遭到日本黑龍會的追擊。砍手江湖經驗老到，依靠袍哥會和特務周旋，扈渝雯利用電報機向陸涯求助。陸涯及時趕到，將雅德利接回了黑室。?雅德利明白了自己的處境，安心在黑室工作。陸涯被授命為黑室截聽組的組長。
黑室正式成立，依靠秦敖陸涯李克江等人的優秀能力，以及雅德利在密碼破譯方面的造詣，黑室在很短的時間里就在破譯密碼、抵抗日軍轟炸方面取得了可喜的成績。?陸涯無法原諒扈渝雯對自己的欺騙，他冷淡地對待著扈渝雯，在一起工作的兩人形同陌路。扈渝雯得不到陸涯的諒解，只能向雅德利傾訴心中的苦悶。?蔣委員長巡查西南戰線的云岫行動秘密展開，黑室沒能遏止住重慶猖獗的間諜活動，加上雅德利酗酒延誤了破譯工作，蔣委員長行蹤泄露，遭遇日方轟炸。黑室受到了嚴厲批評，經歷了一次重大挫折。眾人都承擔了責任，雅德利開始端正自己的工作態度。?通過黑室成員的不懈努力，泄露云岫行動的日本間諜終于被俘。頑固的日本間諜自殺了，他讓黑室意識到重慶還隱藏著許多間諜，他們未來的路還很長。?唐大銘為了犒勞黑室成員的辛勞，舉行了一場慶祝舞會。舞會上，雅德利受到了黑龍會的暗殺，多虧陸涯的保護才躲過一劫。四姐的身影出現在了重慶，她現在的身份是慈善商會的會長羅蘭夫人，并和黑室有著親密的接觸。
陸涯故意和扈渝雯保持距離，讓自己埋頭于工作。他的冷漠讓扈渝雯十分傷心。?秦敖一方面逼迫陸涯和扈渝雯盡快了清恩怨，一方面用真情感動著扈渝雯。在秦敖鍥而不舍的追求下，扈渝雯終于回憶起和秦敖曾經的幸福時光，答應和秦敖結婚。就在此時，黑室破譯出一份重要的密電，密面顯示日軍將于五月一日對重慶實施大轟炸。?憑借破譯出來的詳細情況，重慶成功抵御了日軍的空襲，黑室洋溢在勝利的喜悅之中。?然而重慶方面抵御的空襲只是一個煙霧彈，五月三日，日軍真正的大空襲來臨了，由于情報的失誤，毫無防備的重慶受到了重創。陸涯等人發現，原先黑室破譯的其實是份假情報，截獲情報的永福引疚自殺了。黑室里一片沉痛。